Внутренний блок может загрязнится по причине загрязненности внешнего, нужно почистить всё в комплексе, иначе через время после прочистки внутреннего блока, проблема снова возникнет.
Естественно, что каждый год нужно проводить комплексную чистку, иначе в вашем кондишине появиться изначально плохой запах, а потом может и сам кондиционер выйти из строя.